營利事業給付員工的醫藥補助費，屬所得稅法第 14條第1項第3類規定薪資所得中之各種補助費之一種，故須併入員工薪資所得申報，課徵所得稅；另員工因遭受職業災害，在醫療中不能工作，或經醫院診斷審定為喪失原有工作能力，雇主依勞動基準法規定給付之補償金，係屬損害賠償性質，員工取得該項補償金得依所得稅法第4條第3款規定免納所得稅；惟員工因職業災害領取營利事業另外給付之「醫藥補助費」，亦屬前揭 薪資所得中之各種補助費之一種，仍應依稅法規定申報所得課稅。
該局提醒，營利事業給付遭受職業災害員工之「損害賠償」及「醫藥補助」時，於稅法上所得之認定有別，應注意所得稅法之課稅規定，避免產生漏報情形遭受處罰。
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