南區國稅局表示：營業人間若互相交易，應就各自交易金額分別開立統一發票，而非以互抵後之淨額單方開立發票。
該局說明，依加值型及非加值型營業稅法第1條、第35條規定，營業人於我國境內銷售貨物或勞務應依規定課徵營業稅，並於期限內向主管稽徵機關申報銷售額、應納或溢付營業稅額。
該局舉例說明，轄內甲公司99年間將路面修護工程總價640萬元發包給乙公司，並就該路面刨除剩餘之材料折抵應給付乙公司之工程款40萬元，由乙公司開立銷售淨額600萬元之工程款發票予甲公司，但上述交易其實是甲公司以該刨除料為買賣標的出售予乙公司，該刨除料折抵價值由工程款中扣除，僅是債權債務相互抵銷之計算方式，並非工程總價之減少，該局乃認定甲公司未依規定開立及取得憑證40萬元，予以補徵營業稅，並依稅捐稽徵法第44條及營業稅法第51條第1項第3款規定處罰，甲公司不服，遂提起行政訴訟，案經臺灣臺南地方法院行政訴訟簡易判決敗訴確定。
該局提醒，營業人間互有交易，應就各自交易分別開立統一發票與對方，並如實全額申報營業稅，千萬勿以交易金額互抵後之淨額單方開立統一發票，否則一經查獲將遭補稅處罰，得不償失。
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