南區國稅局臺南縣分局答覆：營業人遺失已開立統一發票存根聯者，如於未經檢舉及未經稽徵機關或財政部指定之調查人員進行調查前，取得買受人蓋章證明之原收執聯影本者，得免除相關處罰，但若開立之發票已不記得買受人及金額多少且尚未報繳營業稅時，此時營業人應向所轄稽徵機關報備及預估開立發票銷售額，並如期申報繳納營業稅，稽徵機關再以預估數依稅捐稽徵法第44條未依規定保存憑證處以5％罰鍰，爾後如交查異常資料產出漏報銷售額大於預估數，再依加值型及非加值型營業稅法第51條第3款規定處罰。
統一發票遺失了怎麼辦？
財政部臺北市國稅局表示，接獲營業人詢問統一發票遺失應如何補救？或空白未開立發票遺失又該如何處理？
該局說明，營業人遺失統一發票，依統一發票使用辦法第23條規定，視所遺失之發票性質按下列三種情形處理：
1.遺失空白未使用之統一發票：應即日敘明原因及遺失之統一發票種類、字軌號碼，向所在地主管稽徵機關申報核銷。
2.遺失已開立統一發票存根聯：如取得買受人蓋章證明之原收執聯影本者，得以收執聯影本代替存根聯，依開立銷售金額報繳營業稅。
3.遺失統一發票扣抵聯或收執聯：如取得原銷售營業人蓋章證明之存根聯影本，或以未遺失聯之影本自行蓋章證明者，得以影本替代扣抵聯或收執聯作為進項稅額扣抵憑證或記帳憑證。
該局指出，依稅捐稽徵法第44條規定，營利事業依法規定應給與他人憑證而未給與，應自他人取得憑證而未取得，或應保存憑證而未保存者，應就其未給與憑證、未取得憑證或未保存憑證，經查明認定之總額，處5﹪罰鍰。營業人若遺失已開立之統一發票，應留意是否已依照規定取得與上開原應保存憑證相當之證明，以免遭受處罰。
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